抗SS-A(Ro)识别的表位位于细胞内与小核糖核酸hY1、hY3、hY4、hY5形成复合物的两种蛋白质(60×103和52×103)上。这种核糖核酸蛋白颗粒的功能目前还未知，患者血清内的自身抗体可能针对其中一种，或者更常见的是同时针对两种蛋白复合物。从分子生物学观点看，两种蛋白及它们基因高度保守，有特征性重复，两者间并无密切联系。因此，同时出现抗两种蛋白的抗体并非由于交叉反应。