抗核抗体(ANA)是最常出现于自身免疫性风湿病(结缔组织病)患者血清中的一组自身抗体的总称，其靶抗原为真核细胞的核成分，但也包括某些细胞质和细胞骨架成分。核染色质中的抗原有DNA、组蛋白、高活动组(highmobilitygroup，HMG)蛋白、DNA拓朴异构酶-1、增殖细胞核抗原(PCNA/eyclin)、RNA聚合酶-1以及核仁结构区(nueleolusorganizingregions，NOR)相关蛋白等;核质中的抗原为核糖核蛋白，包括U1～U6RNA、转移RNA(tRNA)、信使RNA(mRNA)、异质性细胞核RNA(hnRNA)以及许多其他的小RNA，即小的细胞核RNA(snRNA)与特定蛋白质的结合物，如U1、U2、U4～U6RNP(Sm抗原)、U1RNP、hnRNP等;核膜上的靶抗原主要有称之为膜孔复合物的一组蛋白质和核膜内层的层蛋白(lamins)。

除此之外，在细胞质中也有一些核糖核蛋白，即小细胞质RNP(scRNP)如Ro/SS-A抗原。产生的机制不清楚。某些抗核抗体有相对的疾病特异性，如全身性红斑狼疮(SLE)患者血清中出现的抗双链DNA抗体和抗Sm抗原抗体;硬皮病时出现的抗Scl-70(DNA拓扑异构酶-1)抗体等。由于很多抗核抗体的靶抗原是细胞核内有特定分子结构和功能的核酸和蛋白，自身抗体与它们的结合，可能会对细胞的增殖及相应功能产生影响。