在乙肝e抗原转阴后数月出现乙肝e抗体阳性。一般来说，乙肝e抗体阳性预示患者的传染性已显著或相对降低。病毒复制程度已降低或明显缓解。近年发现许多乙肝e抗体阳性，但乙肝病毒脱氧核糖核酸(HBVDNA)亦为阳性的异型乙肝患者，其病情迁延不愈。这是感染了变异的乙肝病毒所致，临床上不可忽视。但也有学者认为乙肝e抗体的产生，只意味着乙肝病毒大部分被清除，但并不意味着慢性肝炎的痊愈。

乙肝e抗体并不是一种保护性抗体，e抗体的出现一般代表着乙肝病毒复制减少或已基本停止。如果乙肝患者出现e抗体阳性也不能掉以轻心，需要根据乙肝HBV-DNA检测做进一步的判断。