抗双链DNA抗体(抗dsDNA)是抗DNA抗体中的一种。其反应位点位于DNA脱氧核糖磷酸框架上。抗dsDNA主要出现于SLE患者的血清中，对SLE患者的组织器官损伤有致病作用。在SLE患者血循环中，大分子的DNA浓度显著高于正常人，DNA还可与多种器官的微血管结构包括肾小球基底膜上的硫酸乙酰肝素(heparansulfate)结合，抗dsDNA抗体可与这些循环中的和器官原位的DNA分子反应，形成抗原抗体复合物，激活炎症系统如补体活化途径，导致组织损伤。

也有人认为，致病性抗DNA抗体在肾脏中的沉积并非只取决于抗DNA抗体与DNA的结合，而是通过与基底膜上硫酸乙酰肝素、层粘连蛋白(laminin)、心磷脂等非DNA抗原的交叉反应或静电引力作用固定于肾脏，诱导炎症反应。抗DNA自身抗体中有的有致病性，有的没有致病性。致病性的抗DNA抗体具有以下特性亲和性高，能与补体结合，能结合dsDNA，带正电荷，多反应性，为IgG类。近年来的研究发现，抗DNA抗体能穿入活的淋巴细胞，干扰细胞功能，引起细胞凋亡，抗dsDNA抗体也能进入肾小球膜细胞，引起肾小球细胞增殖，促细胞融合和蛋白尿形成。这可能是致病性抗DNA抗体的另一特征。