乙型肝炎病毒e抗原是以隐蔽形式存在于核心颗粒中的可溶性蛋白，分布于细胞间隙，可能与病毒复制有关。

乙型肝炎病毒e抗原是乙型肝炎病毒的核心部分，故一般认为乙型肝炎病毒e抗原阳性是具有传染性的标志。在潜伏期乃至整个病程中，乙型肝炎病毒e抗原均可检出;乙型肝炎病毒e抗体是乙型肝炎病毒e抗原的相应抗体，一般认为乙型肝炎病毒e抗原消失和乙型肝炎病毒e抗体出现是病情趋于好转的征象，但并不意味着乙型肝炎病毒DNA停止复制或传染性消失。