任何与精液的生成或运输有关的器官和部位发生感染时，都会从精液中检出微生物。迄今已从精液中检出的微生物达30多种，包括细菌、支原体、衣原体、梅毒和病毒等。常见的病原微生物有金黄色葡萄球菌、链球菌、淋病奈瑟菌、类白喉杆菌和解脲支原体等。近年来，很多学者致力于生殖微生物学研究，发现生殖道感染所致的不育发病率比非感染性不育高出4倍，这表明细菌性感染是引起男性不育的一个原因。

特别是近几年来，性传播疾病如由淋球菌、梅毒螺旋体、衣原体、疱疹病毒及艾滋病病毒引起的生殖道感染已较常见，由此而带来的对男性生育力的损伤更不可低估。因此，通过对精液进行涂片或培养检查，能及时发现上述致病菌，对男性不育的诊断，治疗都具有十分重要的意义。