血清中甘氨酰脯氨酸二肽氨基肽酶测定对鉴别肝脏良性及恶性病变，监测癌的肝转移，和胃癌的检出均具有诊断意义，尤其是对甲胎蛋白(AFP)阴性的原发性肝癌和转移性肝癌的诊断有一定价值。

在血清AFP阴性和阳性的原发肝癌病人中，血清GPDA升高的阳性率基本一致，而肝血管瘤病人的血清GPDA活性在正常范围。70%以上的胃癌病人的血清 GPDA明显下降，胃癌切除后，病人血清GPDA呈回升趋势。血清GPDA测定对鉴别肝脏良恶性病变，监测癌的肝转移和胃癌的检测，均具有意义。